1. 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的過程中，蛋白質的遷移率不僅和蛋白質的等電點有關，還和蛋白質的分子量以及分子形狀有關，其中蛋白質的等電點是最重要 的影響因子，要根據蛋白質的等電點來選擇對應的電泳緩沖系統； 2. 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的過程中，要注意電壓過高引起發熱而導致蛋白質變性，所以最好在電泳槽外面放置冰塊以降低溫度； 3. 蛋白質的分子量較大，則電泳時間可以適當延長，以使目的蛋白質有足夠的遷移率和其它的蛋白質分開，反之亦然; 4. 變性樣品的離子強度不能太高（I<0.1mM）。調整樣品的PH在4.0左右，這對于能否做好非變性樣品非常重要。