目前,在飼料中添加的酶制劑都是由微生物生產的。利用微生物來生產酶制劑的兩種方法,一是固體發酵,二是液體發酵。目前國產復合酶大多為固體發酵,生產的復合酶質量不穩定,發酵水平和酶蛋白的產量也較低。另外我國飼料廠顆粒飼料制粒溫度普遍較高,溫度對復合酶的酶活性有不同程度的影響,降低了酶制劑的使用效果,因此,如何減少在生產加工、貯存過程中對酶活性的影響是目前需要解決的重要問題之一。一方面要利用基因技術，開發研究出活性更高，適用條件更廣的耐高溫、耐酸、耐壓的酶制劑及其包被材料。另一方面，改變傳統的酶制劑添加工藝，采用酶制劑后置添加技術，即將液態酶制劑在飼料制粒、膨化后添加到飼料中去的技術，這樣就可避免在飼料預處理和制粒、膨化過程中損失添加劑的有效成分。
不同的家禽消化生理不同，同一禽種的消化生理在不同年齡階段也有所差異。酶是一種活性物質，溫度、PH值和重金屬等環境條件對其活力影響很大，因此應加強對不同禽種消化道內環境的研究，使飼料酶達到最佳效果。此外，飼用酶制劑的檢測方法也應得到更深入的研究，使得測定結果能貼近實際，指導生產實踐。