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  •   2014年10月8日,《自然?通訊》(Nature Communications)發表了我校作物遺傳改良國家重點實驗室水稻表型組研究團隊和華中科技大學生物醫學光子學研究中心最新研究成果,題為“結合高通量表型測量技術和全基因組關聯分析技術促進水稻遺傳結構解析”(Combining high-throughput phenotyping and genome-wide association studies to reveal natural genetic variation in rice)。我校楊萬能副教授、郭子龍博士生、黃成龍老師、段凌鳳老師、陳國興副教授為共同第一作者,熊立仲教授為共同通訊作者。

      隨著高通量測序技術和植物功能基因組學快速發展,傳統的作物表型檢測手段已成為植物基礎生物學研究包括遺傳、生理、基因功能研究等的主要限制因素。為了解決這一瓶頸,本研發團隊研制了一種全生育期高通量水稻表型測量平臺,可以自動提取水稻株高、葉面積、分蘗數、生物量、產量相關性狀等15個參數,且該平臺總計可容納5472盆水稻種植,連續24小時工作測量通量可達1920盆/天。基于該平臺所獲取的表型數據并結合全基因組關聯分析發現,本方法不僅有潛力取代傳統的表型測量手段,還可發掘出更多新穎的基因位點。對圖像分析技術做適當的修改,本平臺還可擴展應用于小麥、玉米、油菜等其他作物表型高通量測量和功能基因組研究。可以預見,結合高通量表型平臺和全基因組關聯分析技術,必將成為植物基礎研究學者快速解碼大量未知基因功能的重要科學工具。

      我校表型組研究團隊多年來一直致力于植物表型組學這一新興交叉學科研究,旨在將光電成像、自動化控制、計算機、機械制造等工程技術集成創新應用于水稻功能基因組、水稻抗旱等農業研究。

      該工作得到了863計劃、國家自然科學基金、中國創新研究群體科學基金、高校新世紀優秀人才計劃、及中央高校基本科研業務費專項資金資助項目的資助。

      此外,本聯合研究團隊于2013年應邀在《Current Opinion in Plant Biology》發表題為(Plant phenomics and high-throughput phenotyping: accelerating rice functional genomics using multidisciplinary technologies)綜述文章,詳細介紹了國際前沿植物表型組技術在水稻功能基因組研究中的應用。

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