本病除需與一般疾患鑒別外，在臨床上主要需與以下病種相區別：
1.脊髓型頸椎病 在未對患者進行詳細的臨床與影像學檢查前易將兩者混淆。但如能想及本病，并對上頸椎攝以動力性點片則不難鑒別。
2.椎動脈型頸椎病 兩者引起完全相同的臨床癥狀可借助X線片、CT或MRI檢查等加以鑒別，必要時行椎動脈造影或MRA檢查等進行判定。
3.偏頭痛 在枕頸不穩時，由于第1頸神經受累而引起頭后部劇痛，易被誤診為偏頭痛。此時除可根據兩者各自的臨床特點加以鑒別外，對枕大神經行封閉療法將有助于鑒別診斷。
4.頸部腫瘤 椎骨的腫瘤易被發現但椎管內的腫瘤尤其是枕骨大孔附近處的腫瘤則易漏診。作者于十余年前(MRI出現前年代)曾遇到4例脊髓造影陰性而實際為此處腫瘤的病例。因此凡疑及此種情況者，可及早行MRI檢查將有助于早期診斷。
5.其他 尚應與頸型頸椎病、頸背部筋膜纖維織炎及頸部扭傷等鑒別。