1、方法一
試劑:
(1)變性液組成:25 g異硫氰酸胍溶于33 ml CSB中(42 mmol/L pH4.0乙酸鈉、0.83%十二烷基肌氨酸鈉、0.2 mmol/L β-巰基乙醇),65 ℃溶解,過濾滅菌,4 ℃預冷。
(2)酸性酚配制:55 ℃時,500 g酚溶入500 ml 50 mmol/L,pH4.0乙酸鈉,混勻,靜止分層后,去上清,再反復加500 ml 50 mmol/L,pH4.0乙酸鈉,直到pH。
操作步驟:
(1)細胞收集:含一定濃度的細胞培養液置于無菌離心管中,4 ℃,3000 g離心5min;
(2)細胞洗滌:上步沉淀用25毫升滅菌后冰凍的1×PBS緩沖液洗滌,然后4℃,3000 g離心5 min;
(3)細胞破碎:在沉淀細胞中加入15毫升預冷的變性液,用無菌處理過的勻漿器勻漿;
(4)在經變性液勻漿的細胞或組織600 μl+60 μl pH4.0的2 mmol/L乙酸鈉徹底混勻,可用漩渦振蕩器600 μl酚\氯-仿\異-戊醇(25\24\1),徹底混勻或漩渦振蕩器振蕩10 s,冰浴10-15 min,離心,4 ℃,10000 g,20 min,上層水相吸至無菌離心管中,加等體積的異丙醇,-70℃,30 min沉淀RNA,離心4 ℃,10000 g,20 min;沉淀RNA,冷凍干燥15 min,RNA沉淀重新溶于300 μl變性液中.
可振蕩(有時為了幫助溶解,可在65 ℃加熱,但時間應極短)60 μl pH4.0的2 mmol/L乙酸鈉徹底混勻,可用漩渦振蕩器,600 μl酚\氯-仿\異-戊醇(25\24\1),徹底混勻或漩渦振蕩器振蕩10 s,冰裕中10-15 min,離心,4℃,10000 g,20 min,上層水相吸至無菌離心管中,等體積異丙醇二次沉淀(-70℃,30 min),75%乙醇洗沉淀,沉淀冷凍干燥,復溶于去RNA酶的水中(對于準備長期保存的RNA可加入pH 5.0的乙酸鈉至終濃度為0.25 mmol/L,再加入2.5體積的乙醇,-70 ℃保存)。
2、方法二
氯化鋰法提取總RNA 方法用高濃度尿素變性蛋白并抑制RNA酶,用氯化鋰選擇沉淀RNA,其特別適合于從大量樣品中提取少量組織RNA,具有快速簡潔的長處,但也存在少量DNA的污染及RNA得率不高,小RNA-片斷丟失的缺陷。
試劑:
(1)氯化鋰/尿素溶液:氯化鋰126 g(3 mmol/L)尿素、360 g(6 mmol/L)加水至1 L,過濾滅菌
(2)懸浮液:10 mmol/L Tris-HCL (pH7.6),1 mmol/L EDTA (pH8.0),0.5%SDS
操作步驟:
(1)對于大量組織或細胞,則每克組織或細胞加入5-10 ml氯化鋰-尿素溶液,勻槳器高速勻槳2 min,對于少量細胞(107細胞/ml),則每克組織或細胞加入0.5 ml氯化鋰-尿素溶液手工勻槳,并轉移至Eppendof管中;
(2)勻槳液在0-4 ℃放置4 h后,12000 g離心30 min;
(3)取沉淀,加入原勻槳液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液,重復步驟(2);
(4)沉淀用原勻槳液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液復溶后,加入等體積酚/氯-仿/異戊醇在室溫放置15-30 min并不時搖動混勻,4000g離心5 min;
(5)取上層水相,加1/10倍體積的3 mmol/L乙酸鈉(pH5.2)及2倍體積的乙醇,-20 ℃放置1 h,5000 g離心;
(6)70%乙醇洗沉淀一次,真空干燥;
(7)RNA溶解液溶解沉淀,得RNA,分裝,于-70℃保存。
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