中山大學生命科學學院RNA組學團隊楊建華教授等開發了Pol3Base數據和信息庫,系統鑒定RNA聚合酶III(PolⅢ)轉錄的非編碼RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作組、表達、進化、表觀轉錄組、疾病變異及調控網絡。

Pol3Base 網站整合了由不同轉錄因子調控的數千個 RNA 聚合酶 III 轉錄的 ncRNAs 轉錄組數據。Pol3Base 的所有結果都存儲在MySQL數據庫,并通過網頁展示。
RNA組學團隊率先開發一系列分析流程去發掘~79000個PolⅢ轉錄的非編碼RNA(P3RNA)與轉錄因子的互作組以及這些P3RNA與240多種RNA結合蛋白之間的相互作用網絡;揭示了70個正常組織和28種不同腫瘤類型中P3RNA的表達譜及9700個表觀RNA修飾位點。此外,通過比較人類和小鼠,發現了大約4000個進化保守的P3RNA;在32個不同的腫瘤組織中鑒定了上萬種 tsRNA。通過分析體細胞突變數據,Pol3Base還提供研究了這些ncRNA的突變圖譜,以幫助揭示它們在多種疾病中的潛在作用。
該研究近日在Nucleic Acids Res雜志上在線發表,楊建華教授、屈良鵠教授、李斌副特聘研究員和鄭凌伶副教授為論文的共同通訊作者。蔡黎、宣佳佳博士生為共同第一作者。