中性粒細胞減少的原因大致可分為3類：①骨髓增生不良，中性粒細胞增殖或成熟缺陷；②中性粒細胞清除加速；③中性粒細胞再分布。
(1)骨髓增殖異常
①化療后：大多數化療藥物有不同的骨髓抑制副作用，如烷化劑、蒽環類和抗代謝藥物（氟尿嘧啶） ；
②放療后：射線有直接的骨髓毒性；
③骨髓浸潤：轉移性腫瘤；
④骨髓增生異常綜合征：骨髓增生明顯活躍或活躍，但白細胞無法進入外周；
⑤巨幼紅細胞性貧血：維生素B12或葉酸缺乏可導致中性粒細胞減少；
⑥再生障礙性貧血；
⑦急性白血病：不少實體瘤患者會繼發白血病，此外大約25％的急性白血病可表現為全血細胞減少。
(2)中性粒細胞清除加速
①藥物誘導：如吲哚美辛、西咪替丁、雷尼替丁、非那西汀和吩噻嗪類。
②血液透析：補體介導的白細胞凝集素所致的肺內扣留。血液暴露于血透尼龍纖維膜可激活補體旁路，導致中性粒細胞滯留于肺毛細血管，外周中性粒細胞減少。
③菲爾蒂綜合征：中性粒細胞減少，類風濕關節炎病史伴脾大往往提示本診斷可能。
④感染因素：嚴重的膿毒癥患者外周血對中性粒細胞需求劇增，導致骨髓細胞儲存池耗竭，導致外周血中性粒細胞減少。
(3)中性粒細胞再分布
①脾功能亢進：脾大，脾功能亢進，脾區滯留使外周血一系或多系細胞減少。
②邊緣池釋放：中性粒細胞外循環池轉換至邊緣池 。