中國科學院昆明植物研究所研究員高立志聯合華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心等單位的研究團隊,獲得了約116.42 Mb的冬蟲夏草菌高質量的參考基因組圖譜,注釋得到了7,939個蛋白編碼基因。該圖譜不管是從組裝完整性還是準確度上均得到了較大的提升,為從基因組水平上解析冬蟲夏草菌的真菌致病性、高海拔生態適應及其群體遺傳學等研究夯實了基礎。 相關成果于5月11日以在線發表在《科學報告》上。
科研人員研究發現,伴隨著青藏高原的抬升冬蟲夏草菌基因組中的重復序列大量擴增,使得冬蟲夏草菌基因組相比于其它低海拔近緣物種(如蛹蟲草等)變得異常之龐大;但冬蟲夏草菌的蛋白編碼基因卻發生快速地丟失,致使其蛋白編碼基因的編碼區在進化過程中被劇烈地壓縮。與抗低溫密切相關的功能基因在冬蟲夏草菌中大量擴增,這可能有助于冬蟲夏草菌增強自身的抗寒性以便在青藏高原極端復雜的環境下得以生存。
真菌的有性生殖類型,主要由其交配型基因的類型決定。高質量的冬蟲夏草菌參考基因組的獲得與解析證實了冬蟲夏草菌是一種同宗交配型真菌。該基因處于連鎖狀態,其周邊富含有大量的長末端逆轉錄轉座子序列。在冬蟲夏草菌的進化過程中,交配系統曾經歷過多次由同宗-異宗-同宗的轉換,并最終固定為同宗。
眾所周知,比起青藏高原之遼闊,生物種類顯得十分稀少,冬蟲夏草菌的這種同宗交配方式,可能有助于其在青藏高原高海拔環境中快速、低成本地進行有性生殖和繁衍后代,這可能也是造成其有效群體變小的原因。
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