中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”對所有真核生物測序

　　在美國斯密森尼生物多樣性基因組學項目組與中國華大基因公司近日聯合主辦的生物基因組學會議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學戴維斯分校基因組學家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學家張國捷等組成的科研團隊聯合倡議，全球科學家合作開啟另一項與人類基因組計劃（HGP）類似的項目——地球生物基因組計劃（EBP），對地球上所有真核生物進行測序。

　　據《科學》雜志官網報道，EBP計劃大約兩年前第一次提出，將著重對包括所有植物、動物和單細胞生物在內的真核生物群體進行測序。倡議團隊估計，得益于測序技術的進步和成本下降，可能只需10年時間以及與HGP相當的費用（約27億美元），就能完成對全部真核生物的測序。

　　現有EBP框架大約分三步完成：第一步，為9000個真核生物科中的每科選出一個代表進行DNA測序，獲得的參考基因組要與人類基因組相當或更好；第二步，對15萬到20萬個真核生物屬中每個屬選取一個物種測序，詳細程度不需達到第一步的標準；第三步，對150萬個真核生物物種進行粗略性測序。

　　項目倡議人員表示，EBP已經取得良好開端，好幾個測序項目已經啟動，包括為1萬種脊椎動物進行基因組測序的基因組10K項目、破譯5000種節肢動物基因組的i5K項目、為1萬多種禽類物種測序基因組的B10K項目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰斗機中的戰斗機’。”萊文說。

　　在會議上，中國華大基因和英國韋爾科姆基金會桑格研究所等基因組學領頭企業，表明了積極參與的立場，但EBP項目目前仍面臨重大挑戰：一是因生物多樣性問題，只有更多發展中國家參與并開展更加國際化的合作，該項目才能最終成型；二是制定高質量測序和保存有機體樣本的標準，其中因現有博物館動植物樣品的保存方式不符合要求，或需要大量的野外采集樣品，這可能耗費很大成本。