生物分子間相互作用,尤其是基于動態修飾的生物分子間識別互作,是生命活動在分子層面的具體體現,也是生命調控的重要生化分子基礎。因此,發現和鑒定生物分子互作對是了解信號轉導、基因調控、以及功能復合物形成的基礎和前提。
來自清華大學醫學院,美國德州大學MD安德森癌癥中心等處的研究人員發表了題為“Developing spindlin1 small-molecule inhibitors by using protein microarrays”的文章,通過構建組蛋白閱讀器結構域蛋白芯片,并結合基于結構的構效關系演化,開發出專門針對Spindlin1的活性小分子抑制劑,為今后模式結構域靶向的藥物篩選與開發提供了一種新技術模式。
這一研究成果公布在Nature Chemical Biology雜志上,文章通訊作者分別為清華大學生科院李海濤教授,MD安德森癌癥中心Mark Bedford教授、意大利薩萊諾大學Gianluca Sbardella教授。文章第一作者之一為海濤實驗室博士后蘇曉楠。
李海濤教授長期致力于新型表觀遺傳“修飾-識別因子”互作對的發現和功能鑒定,先后發現并闡明了包括YEATS、PHD鋅指等在內的一系列“閱讀器”(reader)結構域識別組蛋白酰基化、甲基化等修飾的分子基礎和調控機制。
比如其研究組曾發現了一種新型組蛋白乙酰化閱讀器(reader)-YEATS結構域,揭開了組蛋白乙酰化轉錄調控研究新篇章.這是繼1999年把溴域定義為組蛋白乙酰化閱讀器后,組蛋白乙酰化識別調控領域的一個重要突破,開啟了組蛋白乙酰化轉錄調控研究新方向。
近期這一研究組也在PNAS上發文(Kinetic and high-throughput profiling of epigenetic interactions by 3D-carbene chip-based surface plasmon resonance imaging technology),報道了基于三維表面和卡賓化學的表面等離子體共振成像(SPRi)微陣列技術在檢測生物分子互作尤其是修飾依賴互作中的應用。
這些研究都是李海濤研究組嘗試在表觀遺傳互作工具方面的開發,突出了高通量“lab-on-chip”微陣列技術在表觀遺傳學研究的重要推動作用。
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