三、機理（藥靶）
這一步就是說明藥物為啥有功能表型。其實就是找受藥物調控的疾病功能基因。
在疾病研究中，我們希望找到的疾病功能基因，是在正常組中低，疾病組中高。也就是說，由于這個基因的高表達導致了疾病的發生發展。這樣的基因作為藥靶的成功率高些。
在中藥研究中，我們希望藥靶的表現是，正常組低，疾病組高，疾病治療組低。季博把這類基因叫做“山“字形基因。三組的表達差異呈現”山“字形。
在正常組，疾病組，疾病治療組中的“山“字形基因。季博分成3類。
1 、1 類。為已知疾病相關的信號通路基因。
這類基因其實是現在中藥發SCI最多的一類。分值不高。
2 、2 類。為已知疾病相關的重要疾病基因。
如果做這類基因，分值就高些了。“p53是抑癌基因嗎-轉錄調控-甲基化乙酰化-藥靶“這篇文章中的nature文章，所做藥靶季博歸為2類。季博日志中凡是標題帶有”藥靶“的文章，希望大家都看看。如果在自己做的篩選過程的，”山“字形基因中有這些基因在。那么就做這些基因去。因為季博分享的文章都是nature。且基本上是今年的。把這些基因作為自己研究藥物的藥靶，是非常新的。
3 、3 類。未知的疾病相關基因。
其實，在季博幫人設計課題的時候，如果是著急拿國自然發SCI，那么就做做1類2類的藥靶。但其實3類藥靶是最好的。因為創新性是最高的。藥靶是新發現的，藥物跟藥靶的關系也是新發現的。
OK。不管是1類2類還是3類藥靶，都需要在研究中進行藥靶鑒定。藥靶鑒定，其實就是我們的疾病功能基因研究的三大塊，再加上“藥靶與藥物的相關性“。
疾病功能基因研究的三大塊，臨床相關性，功能，機制。這部分大家想了解的話，看下“課題設計思路“。
藥靶與藥物的相關性。其實與我們做疾病功能基因機制時，闡明A基因與B機制間的關系，其實是一樣的思路。把A基因換成我們的藥物。
1 、分子相關性
加藥后，藥靶的改變。
2 、功能相關性
a 、加藥后，藥靶下降，細胞有功能表型。那么單獨把藥靶干擾，看功能表型是否與加藥一致。其實，這里的藥靶如果是1類和2類，這個實驗別人是已經做過的。我們需要重復下。
b 、加藥后，藥靶下降，細胞有功能表型。那么在加藥的前提下，把藥靶做過表達，看細胞表型是否回復。這個步驟，其實是很多nature上會做的。以證明，藥物的功能確實是通過該靶點。這就是rescue實驗。
3 、直接互作
這里跟大家說聲抱歉。我們說到現在的藥靶，是藥物的起效藥靶。是否為直接的結合靶點，不一定。藥物跟藥靶間要做到直接互作的話，藥物需要是單體。從單體找可結合的蛋白。且該蛋白為疾病功能基因。如果能夠做出來，直接投nature medicine吧。
大道至簡。在疾病功能基因研究中，總結一句話就是“A基因通過調控B信號通路影響C疾病的D功能“。創新性放A基因上，也就是A基因與疾病的關系是首次報道。
對于中藥研究。總結一句話就是“藥物E通過調控A基因影響B信號通路抑制C疾病的發生發展“。創新性放什么地方呢。
1 、藥物E 與疾病的關系是已知的。
這種情況適合科研剛起步的筒子們。因為藥物與疾病關系是已知的，也就是評估有效性中的動物模型或細胞模型是已知的。那么我們只需要尋找藥靶就可以了。
a 、A基因與疾病的關系是已知的。
這種情況下，藥物E與疾病是已知的。A基因與疾病關系是已知的。創新性在于藥物E與A基因的關系是首次報道。可以發SCI，但創新性小，分值不高。除非，藥物是單體，該單體與A基因直接結合。
b 、A基因與疾病的關系是未知的。
這個是季博建議的方向。因為單A基因與疾病的關系，證明好了，就是很好的課題。如果按照“課題設計思路“中的去做，做好了10分以上也沒問題。這個就屬于疾病功能基因研究。在此基礎上把藥物的工作加進來。創新性是有保障的。其實，不少中藥中標的國自然，就是做的這個地方。
2 、藥物E 與疾病的關系是未知的。
這種情況，需要先化大精力在疾病模型和有效性評估上。
因為藥物E與疾病關系是新的。那么A基因如果是老的話，故事容易被人理解。如果也是新的，創新性好，不過需要好好設計課題來證明清楚。
這里，季博給大家說個事情。有個老師，按照中標標書的課題，設計完，能夠發表SCI文章的前提下。季博提出再找找新的藥物。
中藥有個說法為“扶正祛邪“。扶正為養。驅邪為毒。這位老師是做腫瘤的。模型啥的都容易搞定。藥物上，季博建議到中藥中找驅邪的藥物。這類藥物，對于在腫瘤上來做研究的話，細胞和動物模型上容易操作。這兩天看到微信上，張亭棟老先生拿到”求是“獎。Arsenic
trioxide ，就是中藥中屬驅邪，毒的類型。還有就是雷公藤。大家找找吧。
做中藥的筒子們，如果想找人討論課題，可以找季博。因為我們想讓您的科研更專業，更簡單。同時，季博也希望，大家把中醫中藥傳承好。