親和標記指用對具有特異的親和性物質中導入化學反應基團的試劑，有選擇地修飾存在于活體高分子的對應結合部位的官能基。
因根據親和標記的目的而設計的試劑，對相應的活體高分子具特異的親和性，故形成試劑與活體高分子的特異的復合體，結果在結合部位試劑之濃度特別高，因而結合部位的官能基得到良好的修飾。
例如，對以芳香族氨基酸為特異的基質的胰凝乳蛋白酶，用基質類似物的TPCK（L-1-甲苯磺酰胺-2-苯乙基氯甲基酮）與之反應，則TPCK在苯丙氨酸之側鏈部分與胰凝乳蛋白酶進行特異的結合，在氯化甲酮部分反應，只是在活性部分存在的組氨酸殘基有選擇地烷基化。為了標記酶的活性中心。
效應物的結合部位、抗體的抗原（或不全抗原）的結合部位、受體的激素或神經傳遞物質結合部位、植物外原凝集素的糖結合部位和核糖體的核酸結合部位等，分別設計出導入與之相應的活體分子化學反應基的試劑。
最近基于這樣的目的，即從一般與化學試劑反應性低的殘基所結合的部位為特異標記，應用了導入在光照下獲得高度化學反應性的基團的活體分子類似物（光親和標記photoaffinity labeling）。