乙醛酸循環是植物和某些微生物（大腸桿菌、醋酸桿菌等）及一些無脊椎動物細胞內脂肪酸氧化分解為乙酰CoA之后，在乙醛酸循環體(glyoxysome)內生成琥珀酸、乙醛酸和蘋果酸；此琥珀酸可用于糖的合成的過程。大多數動物和人類細胞中沒有乙醛酸循環體，無法將乙酰CoA轉變為糖。
油料植物種子(花生、油菜、棉籽等)萌發時存在著能夠將脂肪轉化為糖的乙醛酸循環。
水稻盾片中也分離出了乙醛酸循環中的兩個關鍵酶——異檸檬酸裂解酶和蘋果酸合酶。
