1、制作優質青貯飼料
青貯飼料的制成是依靠乳酸菌的發酵來完成的，乳酸菌作為一種厭氧菌，依靠植物中的糖分維持生存，兩者相互依存。乳酸菌在畜牧業的應用中一般是對同型乳酸菌進行接種，從而使青貯飼料中 pH 值適當降低， 使其中的乳酸含量上升，從而使青貯飼料的品質得到提高。在青貯過程中，乳酸菌通過不斷生長繁殖，將植物中的糖分轉換成乳酸，而大量的乳酸菌的生長又制了其他菌類的繁殖，保持了植物養分的完整性和安全性。而且，青草植物通過乳酸菌的發酵，還能提高牲畜的食欲。同時，有乳酸菌發酵制成的青貯飼料在冬季等枯草季節也能為牲畜提供口感好、養分高的優質草料，受到各類家畜和養殖畜牧業的熱烈歡迎。
2、提高禽畜生產性能
在禽畜的生產過程中， 使用乳酸菌能夠使其生產性能得到改善。例如，分別添加 0.50%濃度、0.10%濃度、0.05%濃度的乳酸菌，能夠發現使用乳酸菌，可以使雛雞的成活率得到顯著提高；防止仔豬腹瀉病的發生是養豬的關鍵。 當其發生腹瀉時，乳酸菌可將乳糖轉化為乳酸，因而降低了腸道 pH 值，抑制了大腸桿菌的生長。研究證實，乳酸菌制劑能明顯提高斷奶仔豬的生產性能。
乳酸菌代替抗生素在水產養殖中的應用主要體現在水質改良、治療疾病以及對水產動物免疫等方面。以飼料形式飼喂的乳酸菌一部分可以在腸道內定植，大部分則通過糞便排泄到水中，從而使水體中乳酸菌的數量升高成為優勢菌。這樣不僅可通過競爭性抑制作用明顯抑制腸道和水體的弧菌，而且還可通過直接的化學作用和間接的促進微生物的反硝化作用消除水體中的亞硝酸鹽，起到凈化水質的效果。
乳酸菌類微生態制劑為飼料和畜牧水產養殖業提供了一條高效、無害、無污染的新選擇。隨著越來越多的新菌種和特異性菌株在生產中使用，我們要充分考慮動物菌群自身特點以及寄生與環境之間的關系，科學合理地使用，使其達到最大的生態效應和經濟效益。