人乳鐵蛋白和牛乳鐵蛋白以及乳鐵蛋白衍生肽都具有針對人類病原性真菌(特別是白色念珠菌和其他幾種念珠菌)的體外活性。乳鐵蛋白可以同抗細菌一樣,通過改變細胞表面的通透性來殺死白色念珠菌和克魯斯梭菌。乳鐵蛋白可以改變新隱球菌和白色念珠菌的細胞質和線粒體膜的通透性。乳鐵蛋白的抗真菌作用機制是通過與細胞表面相互作用來實現的而不是鐵的剝奪。