記者從9月7日召開的“二倍體棉花-雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成”新聞發布會上獲悉,由該中國農業科學院棉花研究所主持,深圳華大基因研究院、北京大學、美國農部南方平原研究中心、荷蘭瓦赫寧根大學等單位共同合作完成了二倍體棉花-雷蒙德氏棉的全基因組草圖,研究成果以“二倍體棉花-雷蒙德氏棉的基因組草圖”為題目在線發表于國際權威學術期刊《自然—遺傳學》。這標志著我國棉花基因組學研究取得了國際領先的地位,該成果對棉花基礎研究和應用研究將發揮巨大的推動作用,為我國棉花重要功能基因挖掘與利用、分子育種,乃至全基因組設計育種提供前所未有的機遇。
棉花是全球最重要的經濟作物之一。它的纖維、俗稱皮棉,是紡織工業主要的天然原料。全世界棉花種植面積約5億畝,我國常年種植面積近8千萬畝。2011年全球紡織工廠年度市場價值大約為6306億美元。除了它的經濟價值,棉花也是一種研究多倍體化、細胞伸長和細胞壁生物合成極好的模式系統。
棉花基因組計劃(CGP)由中國農業科學院棉花研究所發起并主持實施,主要致力于棉花全基因組測序和功能基因挖掘與利用。雷蒙德氏棉是現在陸地棉祖先的兩個供體種之一,該棉花基因草圖的完成,為進一步解析陸地棉全基因組序列奠定了堅實的基礎。
研究團隊采用全基因組鳥槍法結合新一代的高通量DNA測序技術,對雷蒙德氏棉進行了全基因組測序,獲得了其87.7%的全基因組序列,研究結果證明棉花基因組經歷了真雙子葉植物共同經歷的一次古六倍化事件和一次棉屬特異的全基因組復制事件,表明了其古多倍體起源。
此外,研究人員推測雷蒙德氏棉基因組約包含有40,976個蛋白質編碼基因。進化分析發現,目前,只在棉花與可可發現了CDN1基因家族,這一家族是棉酚生物合成的關鍵,而棉酚是棉屬特有的一類物質。從基因組注釋結果中發現2,706轉錄因子,其中大量的MYB和bHLH基因在花后0天和3天的胚珠中表達,暗示這些基因可能是早期纖維發育所必須。
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