1.左室破裂
二尖瓣置換術后左心室破裂十分罕見，一旦發生往往致命。當左室壁薄弱是，過度切除或牽拉乳頭肌可能引起左心室破裂。如果存在急性或亞急性心肌梗死，特別是老年患者也可能發生左室破裂。采用先進的保留二尖瓣瓣下結構的完整性的手術方式，可以降低左室破裂并發癥的發生率。
治療心臟破裂的方法包括立即重新建立體外循環。取出人工瓣膜后用牛心包片與左心室內膜縫合修補穿孔，再植入人工瓣膜。如果停止體外循環后在手術室發現左室破裂，預后較差。而在監護室內發生的，常常是致命的。
2.房室間溝和回旋支動脈損傷
過度清除二尖瓣后瓣及瓣環的鈣化病灶，有可能引起房間溝的血腫、房室分離或心臟破裂。如換瓣線在后瓣瓣環上縫的過深也有可能損傷回旋支動脈。發生此種情況時，需要用大隱靜脈施行回旋支的旁路移植術。
3.主動脈瓣和房事傳導系統的損傷
在二尖瓣前交界和右纖維三角之間縫合過深，可能無意損傷無冠瓣或左冠瓣。同樣在右纖維三角與后交界之間縫合太深也可能損傷房室結和希氏束。后者往往是由于感染性心內膜炎或鈣化病變，對瓣環病灶清除過多，遺留的組織太少以至于換瓣線縫合過深所致。傳導系統的永久損傷，可能需要到術后許多天后才被發現，這時需要植入永久性起搏器。
開放主動脈阻鉗前后，如果左心室因主動脈瓣的反流而膨滿，應考慮有無主動脈瓣葉的損傷。需使用經食管超聲予以確認。相應的處理方法包括重新阻斷主動脈，切開左房和主動脈，取出人工瓣膜或僅剪除影像主動脈瓣的縫線。修補受損的主動脈瓣，重新植入人工瓣膜或在剪除換瓣線的地方重新縫合換瓣線。
4.左心室流出道梗阻
過大的帶支架的生物瓣或高瓣架機械瓣可能影響左心室流出道的射血。重脈（主動脈瓣開放兩次）現象提示這種并發癥的存在，經食管超聲心動圖很容易確診。近年由于低瓣架機械瓣的使用，這種情況已經很少發生。一旦發生這種情況，重癥患者需要重新直入低瓣架的人工瓣膜。如果使用保留腱索的手術方法，前瓣瓣葉可能會引起左室流出道梗阻，表現為收縮期前瓣和腱索的前向運動（SAM）及食管超聲心動圖上的梯度差。處理的方法包括停止應用正性肌力藥物，減輕容量如何，加用β受體阻滯劑和使用收縮血管藥物（例如脫羥腎上腺素）增加心臟后負荷。可以通過經食管心臟超聲檢查來觀察藥物治療效果，一般情況下上述治療能起效，且同樣適用于二尖瓣修復術后因為SAM引起的LVOT梗阻。如果左室流出道梗阻持續存在，需要將主動脈切開，經主動脈切除導致流出道的梗阻的二尖瓣瓣葉。
5.瓣周漏
術后瓣周漏可引起二尖瓣反流，其原因常常是由于換瓣縫線將脆弱的瓣環或殘存的瓣葉撕裂所致。也可能是因瓣環鈣化嚴重，人工瓣膜不能與瓣環嚴密固定。經食管超聲心動圖可以明確診斷，但是判斷瓣周漏的嚴重程度卻比較困難。對于高度懷疑的病例，需要在用魚精蛋白中和后經食管超聲心動圖復查。瓣周漏必須與雙葉人工瓣膜對稱性的“收縮期血流”相鑒別。如果瓣周漏嚴重而且不可耐受，必須及時再次施行二尖瓣置換術，用帶墊片的縫線修補（如果瓣環鈣化嚴重，可采用心房內植入新的人工二尖瓣）。