雙堿基氨基酸尿癥是該編碼轉運蛋白基因突變的結果,均屬常染色體隱性遺傳。由于此種蛋白僅被用于轉運賴氨酸、精氨酸和鳥氨酸,而胱氨酸重吸收正常,故臨床表現與上述三種氨基酸的丟失有關。
由于精氨酸和鳥氨酸的不足,難以維持鳥氨酸(尿素)循環的功能,故臨床產生高氨血癥,以及因對蛋白耐受低,易發生氨中毒,肝脾腫大。