與一級生物安全柜相同，氣體是從外部進入到二級生物安全柜里邊，一般稱作
進流。進流可以避免在微生物操作時產生的氣溶膠從安全柜的操作窗口疏散到實驗室里
。與一級生物安全柜不同的地方是，只讓經HEPA過濾的(無菌的)空氣流過工作臺面。內
置風機把空氣經前面的開口引入安全柜內并進入前面的進風格柵。所以未通過過濾器過
濾的空氣不能直接進入工作區，所以二級生物安全柜能夠確保安全柜內部存放的樣品及
儀器不被外部空氣污染。
不同型號的二級生物安全柜的主要不同在于：排氣的比例和氣體經過空氣高壓
再循環的比例不同。此外，不同的二級生物安全柜各自具有不一樣的排氣方式：有的安
全柜將空氣過濾后直接排到室內，有的是經過連接到通風管道上的套管或通過建筑
物的排風系統排到建筑物外面。
除此之外，所有的二級生物安全柜和一級生物安全柜一樣，可以保護操作人員和實驗室
環境不受危害。同樣，二級安全柜也可以保證產品樣本在微生物操作中不受污染。二級
生物安全柜可以在一，二，三級生物安全水平的生物因子操作中使用。
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