五福化毒丸的副作用一般不大，但如果患者對藥物成分過敏，可能會出現紅腫、瘙癢等副作用。此外，它可能導致惡心嘔吐、腹痛腹瀉、皮疹、肝功能異常等副作用，嚴重時還可能出現神經系統紊亂。常見的副作用還包括頭暈頭痛、皮膚瘙癢等。
