近日,亞馬遜發布了最新的業務模塊——亞馬遜組學分析平臺Amazon Omics。
Amazon Omics 是一項亞馬遜網絡服務 AWS 服務,可幫助生物信息學家、研究人員和科學家等用戶存儲、查詢、分析基因組學和其他生物數據并從中生成見解。 它簡化并加速了研究和臨床組織存儲和分析基因組信息的過程,并加快了科學發現和洞察力的產生。
組學具有三個主要組成部分。 Omics Storage 可幫助您高效地存儲和共享數 PB 的基因組學數據,并且每 GB 成本較低。 Omics Analytics 簡化了為多組學和多模式分析準備基因組學數據的方式。 Omics Workflows 自動為您的生物信息學計算配置和擴展底層基礎設施。
AWS 表示,Amazon Omics 還可以幫助建立基本的生物信息學工作流程并使用現有的 AWS 分析和機器學習服務分析結果,并補充說該服務會隨著使用量的增長自動配置底層基礎設施。
針對生物信息學優化的數據存儲
亞馬遜的首席開發倡導者 Channy Yun 在一篇博文中寫道,新服務基于三個主要組件——優化存儲、工作流托管計算和面向特定類型分析的數據存儲。
為了降低成本,Amazon Omics 使用生物信息學感知存儲選項來存儲原始序列數據。據該公司稱,為了優化運行分析的數據,Amazon Omics 將原始數據導入變體存儲并將其轉換為可作為 Apache Iceberg 表使用的查詢就緒模式。
該服務帶有兩個存儲類別——活動和歸檔。
“自動歸檔默認開啟,這意味著如果數據不定期訪問(超過 30 天),Amazon Omics 會自動將數據移動到更便宜的存儲類別,類似于 Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) Intelligent-Tiering存儲類,從而為客戶節省成本,”AWS Health AI 總經理 Tehsin Syed 在博客中寫道。
Amazon Omics 還支持將原始數據導入注釋存儲。由文件類型標記或標記的數據稱為注釋數據。
科學家和其他用戶可以開始通過該服務的控制臺將數據導入對象存儲。
該服務的托管計算組件為科學家提供資源以運行生物信息學工作流,這些工作流包含一系列協調任務的腳本,這些任務旨在從 Amazon Omics 存儲或 Amazon S3 中提取大量原始序列數據到少量分析數據,例如該公司表示,作為基因組突變,科學家和其他用戶只需指定每項任務所需的計算資源。
“反過來,這消除了與大規模運行和管理這些工作流相關的所有無差別的繁重工作,”賽義德寫道,并補充說工作流中的腳本可以用 Nextflow 或工作流描述語言等語言編寫。
這項可與 Amazon HealthLake 等其他服務結合使用的新服務現已在美國東部(弗吉尼亞北部)、美國西部(俄勒岡)、亞太地區(新加坡)、歐洲(法蘭克福)、歐洲(愛爾蘭)推出) 和歐洲(倫敦)地區。
預計不久將支持更多地區。該服務按消費模型定價。
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