亞麻酸在植物體內屬于常見脂肪酸，一般作為膜脂脂肪酸的基本成分之一。盡管如此，其在大多數植物的種子中含量卻非常低，但仍有部分植物如亞麻、杜仲、琉璃苣（紫草科植物，其主要成分為γ-亞麻酸）、黑加侖（虎耳草科植物）。
亞麻酸是植物體重要物質和能量來源
雖然亞麻酸作為貯存脂肪酸，在碳鏈長度上與硬脂酸和油酸等相同，但所含熱量略低，但并不影響其作為植物體發育過程中作為重要的物質和能量來源。
亞麻酸是細胞膜脂的主要脂肪酸之一
亞麻酸是植物膜脂所含的主要脂肪酸之一。尤其值得指出的是，植物光合膜（類囊體膜）的膜脂所含脂肪酸以亞麻酸為主體（約70%），其含量與光合作用有十分密切的關系。
亞麻酸的分解產物茉莉酸是抗逆生長調節物質
在亞麻酸分解代謝中，已提及亞麻酸通過△9-或△13-氧化可生成過氧凝酸，從而可生成一系列化合物，其中有一類重要的化合物已確定為植物生物調節物質茉莉酸。
從茉莉酸代謝的角度，我們可以理解光合作用減弱與次生代謝的增強之間的辯證關系。而由此，我們也可以認為亞麻酸很可能是植物適應外界不良環境從而調低主代謝的主要感受器。