目前已經篩選和分離到很多能降解角蛋白的細菌，主要為芽孢桿菌。Williamsh等（1989）由家禽羽毛發酵液中富集、分離到了羽毛分解菌，經鑒定為嗜熱型地衣芽孢桿菌（Bacillus licheniformis），這種菌在以羽毛作為其主要的碳氮源的培養基條件下生長最適宜，但不能降解未經高溫蒸煮的羽毛。其他芽孢桿菌包括嗜堿芽孢桿菌（Bacillus pseudofirmus）、枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）、短小芽孢桿菌（Bacillus pumilus）等。另外具有角蛋白酶活性的細菌還有嗜熱厭氧菌、弧菌科細菌（Vibrionaceae）、海島閃光桿菌、金黃桿菌屬等。
細菌生長快、易于繁殖、產酶活性高，角蛋白酶最適溫度、pH值等性質特異，具有良好的應用潛力。