1.原發性免疫缺陷病。
2.繼發性免疫缺陷病，皮質激素，化療，放療后引起或惡性腫瘤等繼發免疫疾病。
3.特發性CD4 T淋巴細胞減少癥，酷似AIDS，但無HIV感染。
4.自身免疫性疾病 結締組織病，血液病等，AIDS有發熱，消瘦則需與上述疾病鑒別。
5.淋巴結腫大疾病 如KS，霍奇金病，淋巴瘤，血液病。
6.假性艾滋病綜合征 AIDS恐怖癥，英國同性戀中見到一些與艾滋病早期癥狀類似的神經癥狀群。
7.中樞神經系統疾病 腦損害可以是艾滋病或其他原因引起的，需予鑒別。
8.與腎病綜合征或其他腎臟病引起FSGS進行鑒別 HIV腎病的FSGS病理特征有助于與其他腎臟病鑒別，但仍缺乏特異性，尤其是與二醋嗎啡腎病(HAN)的病理特征十分相似，應認真加以鑒別。