蛋白質工程是開發有用或有價值的蛋白質的過程。它是一門年輕的學科，正在對蛋白質折疊的理解和蛋白質設計原理的識別方面進行大量研究。它也是一個產品和服務市場，到2017年估計價值為1,680億美元。
蛋白質工程有兩種通用策略：合理的蛋白質設計和定向進化。這些方法不是互斥的。研究人員經常會同時使用這兩種方法。將來，對蛋白質結構和功能的更詳細了解以及高通量篩選的進步可能會xxx擴展蛋白質工程的能力。最終，甚至可以通過較新的方法（包括擴展的遺傳密碼）包括非天然氨基酸，該方法允許以遺傳密碼編碼新氨基酸。
