過氧化物酶(HRP)廣泛分布于植物中,辣根中含量最高,從辣根中提取的稱辣根過氧化物酶(HRP),是由無色酶蛋白和深棕色的鐵卟啉構成的一種糖蛋白(含糖量18%),分子量約40 000,約由300個氨基酸組成,等電點為pH 3-9,催化反應的最適pH值因供氫體不同而稍有差異,一般多在pH 5左右。此酶溶于水和50%飽和度以下的硫酸銨溶液。
酶蛋白和輔基的最大吸收光譜分別為275nm和403nm。