CDS是編碼序列（Coding sequence）的縮寫。
DNA轉錄成mRNA，mRNA經剪接等加工后翻譯出蛋白質，所謂CDS就是與蛋白質序列一 一對應的DNA序列，且該序列中間不含其它非該蛋白質對應的序列，不考慮mRNA加工等過程中的序列變化，總之，就是與蛋白質的密碼子完全對應。
CDS是編碼一段蛋白產物的序列，是結構基因組學術語。開放閱讀框ORF是基因序列的一部分，包含一段可以編碼蛋白的堿基序列，不能被終止密碼子打斷。當一個新基因被識別，其DNA序列被解讀，人們仍舊無法搞清相應的蛋白序列是什么。