CRISPR/Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）是最新出現的一種由RNA指導的Cas9核酸酶對靶向基因進行編輯的技術。CRISPR/Cas9是細菌和古細菌為應對病毒和質粒不斷攻擊而演化來的獲得性免疫防御機制。在這一系統中，crRNA（CRISPR-derived RNA）通過堿基配對與tracrRNA（trans-activating RNA）結合形成雙鏈RNA，此tracrRNA/crRNA二元復合體指導Cas9蛋白在crRNA引導序列靶定位點切斷雙鏈DNA（圖2）。在基因組編輯過程中，tracrRNA和crRNA可以融合成為1條RNA（sgRNA）表達同樣可以起到靶向剪切的作用。CRISPR/Cas9的優點是操作簡單，對基因組的效率高。需要對某一個靶位點編輯的時候，只需要表達相應的sgRNA即可，不需要對Cas9核酸酶進行改造。它可對任何物種的基因組進行高效率的定向編輯。基因組編輯技術的一個缺點是脫靶效應，可能在靶點以外的地方切斷DNA，產生indel。本公司用一個突變的Cas9酶 Cas9n克服了這個局限，，它只切斷DNA的一個鏈，這個單鏈缺口會促進同源重組，但不會產生脫靶突變。