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  • 很容易想象Sean Bendall博士被列入全美“40 Under 40“名錄(每年評選40個在各領域有突出表現的的年輕人);他曾經在斯坦福Nolan實驗室任助理教授,這個實驗室位于美國Palo Alto小鎮,隸屬于加州蛋白質組研究中心的國家心肺和血液研究所(NHLBI)。Bendall不愧是一個年輕人的杰出代表,他的工作深深影響了其所從事的研究領域。當今,一場新興的運動正在生物學界悄然興起,一系列單細胞生物學的技術不斷涌現,它們正在促使科學家以全新的視角重新審視一些傳統的研究領域。而Bendall則正走在這場運動的前沿。

    Fluidigm公司的CyTOF實驗系統,不但使原來復雜的工作流程得到了簡化,同時也將單細胞研究提升到了一個新的水平。基于此,Bendall和他具有前瞻性思維的同事們已經獲得了諸多新發現。他們的研究對象是人的免疫系統,相對于成熟的免疫系統,其發育的動態過程更加的復雜,他們正在利用CyTOF精細的揭示這一過程;這是CyTOF在新領域的應用,也為該領域提供了一個新的研究思路。

    圖二、質譜流式實驗系統組成

    在Nolan實驗室中任職期間,Bendall和他的同事們將蛋白磷酸化流式技術與質譜流式技術結合起來。該實驗室一直致力于流式細胞技術的改進和相關單細胞檢測方法的開發,目前已經成為該領域的領導者。

    通過將蛋白質組學和高級數據分析方法有機結合,這個實驗室成功的對在正常和病變細胞信號通路進行了研究,這種研究方法是革命性的。Bendall從他在Nolan實驗室的這段時間中獲取了很多靈感,并把這些靈感用于自己的新實驗室中。目前,兩個實驗室仍然密切合作,并共享著他們的CyTOF系統。目前,Bendall的實驗室隸屬于斯坦福大學病理系,位于斯坦福血液中心,在這里他重點研究人類造血和免疫系統,以及在健康或者病理(癌變,過敏和自身免疫性疾病)條件下的信號調控機制。

    圖三、利用CyTOF對骨髓的信號通路分析(SPADE分析)

    于此同時,NHLBI和斯坦福的跨學科合作也正在進行中,他們已經在肺動脈高壓(PAH)和自身免疫性疾病等領域開展了四個研究項目。他們的合作正好順應了基因組學和蛋白質組學日益融合的大趨勢。Bendall解釋說,基因組數據具有很寬的覆蓋面,而單細胞蛋白質組學的數據則是在單細胞水平上測量有限的參數。在Bendall本人的工作中,首先利用組學開啟廣闊的思路,再一步步縮小他的假設。“我不假裝自己是一個單細胞分子生物學專家,”接著,他提起了一個在人過敏反應領域的合作伙伴Steve Galli,他可以算得上該領域思想領袖,現任斯坦福大學病理系主任,是研究過敏反應和過敏性免疫細胞功能方面的專家。

    然而,Bendall是一個單細胞蛋白質組學和流式分析技術方面的專家。從理論上講,他可以在他的實驗室進行流式細胞分析,然后將樣本帶到校園另一邊,將它們放到另一個實驗室的檢測系統中進行檢測。所以,他有可能很快就可以溝通大學廣場兩邊的世界。

    看到知識共享的光明前景,同時又擁有實現它的手段,這令一直熱愛技術的Bendall非常興奮。通過多年來系統的科研訓練,他已經成為了一個研究蛋白的生物化學家。他本科的學習一開始專注于生物化學和微生物學領域,隨后逐漸轉到蛋白質化學、蛋白質組學和質譜領域。后來,他曾在一個蛋白質組學實驗室工作,與另一個實驗室合作研究人類造血和胚胎干細胞。

    研究中Bendall注意到,蛋白質組學可以分析上千萬個細胞的總體狀況;而干細胞研究則需了解單個細胞的功能;這似乎是一個悖論。

     “當真正的根本問題在于單細胞的功能時,對大量細胞進行總體分析是很難奏效的。” Bendall回憶道。

    這需要大量的后續工作,因為只有感興趣的細胞正好是大多數時,對于總體的分析才是有效的。正是這種“技術上的障礙”讓Bendall來到了斯坦福,他來尋找一種解決此類問題的工具——那就是基于單細胞檢測的質譜流式技術。

    圖四、單細胞檢測的必要性:總體數據會掩蓋細胞多樣性


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