有絲分裂的過程要比無絲分裂復雜得多，是多細胞生物細胞分裂的主要方式，但一些單細胞如：甲藻、眼蟲、變形蟲等，在分裂生殖時，也以有絲分裂的方式進行：
(1)甲藻細胞染色體的結構和獨特的有絲分裂，兼有真核細胞和原核細胞的特點，細胞開始分裂時核膜不消失，核內染色體搭在核膜上，分裂時核膜在中部向內收縮形成凹陷的槽，槽內細胞質出現由微管按同一方向排列的類似于紡錘絲的構造，調節核膜和染色體，分離為子細胞核，最終分裂成兩個子細胞(甲藻)。
(2)眼蟲營分裂生殖時，核進行有絲分裂，分裂過程中核膜并不消失，隨著細胞核中部收縮分離成兩個子核，然后細胞由前向后縱裂為二(縱二分裂)，其中一個帶有原來的一根鞭毛，另一個又長出一根新鞭毛，從而形成兩個眼蟲。
(3)變形蟲長到一定大小時，進行分裂繁殖，是典型的有絲分裂，核膜消失，隨著細胞核中部收縮，染色體分配到子核中，接著胞質一分為二，將細胞分裂成兩個子代個體。