使用冷凍分裝技術提高糞便微生物菌群研究的效率和質量:突破處理糞便樣本難題
冷凍樣品取樣技術介紹
任何腸道微生物研究工作的起點都是從患者和志愿者那里收集糞便樣本,收集方法會根據操作流程和容器的不同而有所差異。考慮到研究項目的性質、規模以及存儲要求,樣本會被保存為原始狀態或者進行懸浮處理。考慮到收集容器的類型和采集后的樣本制備,冷凍樣品取樣技術能夠處理大部分類型的冷凍糞便樣本規格。CXT350冷凍樣品取樣儀擅長處理大多數類型的樣品收集容器,從2.0毫升小型凍存管到50ml的大型離心管,都可以快速進行設置,以適應當目前種規格的管型。CXT750冷凍樣品取樣儀可以實現完全自動化的冷凍樣本處理,適用于分析通量要求更高的作業環境。如果在樣本收集時或者收集后立即對樣本進行懸浮化或標準化處理,CXT 750將在標準化工作流程和集中存儲的實施過程中,成為強有力的實驗工具。
一般而言,冷凍糞便樣本可以根據需要隨時進行提取樣,而母樣則始終保持在冷凍狀態(以供日后研究)。另外一種辦法是,根據預先計劃的研究項目需要或樣本庫建立/規格重排的需要,母樣本可直接被冷凍取樣等分為若干數量的子樣本,方便日后使用。
該方法僅在無需對母樣本進行保留時使用。
無論是否采用冷凍取樣方法,在沒有多次的反復凍融的情況下,冷凍取出的樣本都可直接用于大多數核酸提取工作。法國農業科學研究院的研究人員近期通過冷凍取樣技術,驗證了這一技術在糞便/腸道微生物研究領域的作用(參見圖1)。法國農業科學研究院將冷凍取樣技術與之前的取樣方法進行對比,進一步研究這一新技術是否適用于他們擬實施的研究項目。
結論
經大量研究證實:我們的腸道菌群與健康、疾病之間存在著復雜的相互關聯,所以,腸道微生物組研究的重要性正變得越來越明顯。由于越來越多的證據可以證明:不同的腸道微生物菌群的形態與診斷、預后之間存在著極強的相關性,甚至是因果關系,科學家們因此也越加關注這一領域的研究。因此,涉及人類糞便樣本采集和分析的研究越來越多,規模也越來越大。目前,在人體腸道微生物菌群的研究中,想要有效和安全地處理大量半固態或懸浮態糞便樣本,冷凍樣品取樣技術是唯一可行的解決方案。
1該資料和數據由法國農業科學研究院(INRA )MetaGenoPolis項日的Joel Dore博上提供。

CXT350冷凍樣品取樣儀
● 利用一次性取樣針,以半自動取樣和分裝冷凍樣;
● 維持原始樣本和取出的樣本在超低溫(< -130℃)冷凍狀態,消除令人不悅(糞便)氣味的同時,最提高科學研究的效拘安全性;
● 適用于方法開發和小規模究。



可容納并處理市面上大部分的樣品管規格,亦可根據需要進行定制,最大限度地提高了在實際應用中的靈活性。

通過消除反復凍融的操作,保持活體微生物遺傳圖譜特性。
冷凍取樣技術可整合到基因組研究的工作流程中,提高研究效率,最大限度地提高樣本存儲率。

可對原始樣本進行重復取樣,無需進行反復凍融即可滿足對樣品進行冷凍分裝的需求。

CXT750冷凍樣品取樣儀
● 以全自動方式取樣和分裝冷凍樣本。
● 維持原始樣本和取出的樣本存超低溫(-80℃)冷凍狀態,在消除令人不悅的(糞便)氣味的同時,最大限度地提高科學研究的效率和作業的安全性。
● 適用于大型群組樣本研究,樣本庫的收集組合、合并和規格重排工作。



SBS標準的樣品管架系統,兼容從2 0rnl凍存管到1 4ml 96矩陣規格等多種樣品管類型,同樣可以根據客戶的需要進行定制。