老式的種子催芽方法主要有體溫催芽法、溫水催芽法、燈泡催芽法和沙子催芽法等，而采用發芽箱催芽是目前比較廣泛的一種催芽方法，優點就是可以有效控制催芽溫度、濕度和時間，而且經過發芽箱催芽的種子育苗成活率高、抗病力強，用于農業生產效果非常好。
而且發芽箱的催芽范圍也非常廣，可以用于蔬菜種子、菌類種子、水果種子、西瓜種子、玉米種子、棉花種子等發芽、催芽，因此環境保護、衛生防疫、藥檢、農畜水產等科研、院校、生產部門都可以使用它來開展中得的發芽、催芽、育種等，是用途非常大，使用非常廣的一款恒溫育苗設備。但是由于發芽箱在種子催芽中的應用還不是很久，很多技術人員還沒有掌握發芽箱催芽的技術要領，因此也出現了一些催芽效果不佳的現象，因此為了保證發芽箱的催芽效果，在使用發芽箱催芽的過程中，有些地方還是需要注意的。
比如說，我們知道種子催芽是具有季節性的，因此在生產緊張的時候，工作人員往往在發芽箱中放置了過多的種子，而實際上，在這樣的情況下，發芽箱很難發揮出其效果，主要是因為箱內堆積過多過厚，會造成同期不良，不利于通風，有時反而會造成爛芽，達不到要求的催芽效果，因此采用發芽箱催芽不僅僅只是滿足了要求的溫度濕度就可以了，還需要注意合開調控箱體的利用空間，此外，還要做到請檢查，防治以外情況的發生，做到及時處理問題。