參閱諾氟沙星，主要為胃腸道反應（3—4%）、中樞神經系癥狀（2%）、過敏反應（0.5一1.0%）和實驗室檢測異常（3—4%），偶可導致癲癇、甚至驚厥（過量易于發生）。不良反應大多輕微，故很少影響治療的繼續進行。見于諾氟沙星的結晶尿、關節痛或僵直、光敏感、視力障礙等也偶可發生于該品療程中。可引起輕度胃腸道刺激或不適、惡心、燒心、食欲不振。有輕度神經系統反應、眩暈、思睡、頭痛、不安、停藥后癥狀消失（恢復正常）。過敏反應、皮疹、搔癢、顏面或皮膚潮紅，結膜充血。還可引起短暫性氨基轉移酶升高，體液潴留等。個別病例可引起肝損害.停藥后癥狀消失（恢復正常）.可引起腎損害，尿素氮升高，腎功能不全者慎用.也有白細胞及血小板減少，嗜酸性粒細胞增多，口腔潰瘍。過敏時引起上呼吸道粘膜充血，喉頭水腫，窒息、皮膚血管炎、關節及肌肉痛、嚴重者可危及生命.
1、司氟沙星的不良反應：腸胃道：惡心、腹瀉、嘔吐、消化不良、腹痛、腹脹、厭食。治療中或治療后如發現嚴重長期腹瀉，必須向醫生咨詢，因為這可能引起嚴重的腸道疾病（偽膜性腸炎），需要及時治療。這種情況一旦發生必須停止使用司氟沙星，并給與適當的治療（萬古霉素口服4×250mg/天），禁用抑制腸蠕動藥。
神經系統：頭暈、頭痛、疲勞、激動、震顫；少見的有：失眠、外周痛覺異常、出汗、步態不穩、驚厥、顱內壓升高、焦慮、夜夢、精神錯亂、抑郁、幻覺也有發生，個別病人出現精神反應。一些病人，初次用藥可能發生這些不良反應，這時，可立即停止服用壞丙沙星并通知醫生。
感覺器官：感覺器官副作用少見，有時可見味覺受損，視覺紊亂（雙視、色視）、耳鳴聽覺的暫時損傷，特別是在高頻率環境中更易出現。高度過敏反應：一些病例，初次用藥可發生過敏反應，在這種情況下，停止用藥，并立即通知醫生。皮膚反應：如皮疹、瘙癢、藥物熱。
2、司氟沙星的少見的不良反應：皮膚點狀出血（瘀點）水皰的形成，伴隨出血（血皰）和有結痂的小結節（丘疹），這顯示了血管炎。StevensJohnson及Lyell綜合癥：間質性腎炎、肝炎、肝壞死，很少導致危及生命的肝衰竭，有些病人，初次給藥可發生過敏性的反應（例：面部、血管性和喉頭水腫；呼吸困難，導致危及生命的體克）；這些情況一旦發生，應立即停藥并給予處理（休克治療）。
心血管系統：心動過速：少見的有潮紅、偏頭痛、暈厥。其它副作用：關節痛：少見的有體弱、肌肉痛、腱鞘炎、光敏感、短暫的腎功能損害，包括短暫的腎衰竭。在使用司氟沙星期間，偶見跟腱炎，因此，一旦出現跟腱炎癥狀（疼痛與腫脹），立即停藥并通知醫生。長期使用司氟沙星可引起由耐藥菌或酵母樣真菌導致的雙重感染。
對血液與血液成分的影響：嗜酸性細胞增多、白細胞減少、顆粒性細胞減少、貧血、血小板減少，偶見的有白細胞增多、血小板增多、溶血性貧血、凝血酶原值改變。對實驗室參數的影響及尿沉淀：轉氨酶，堿性磷酸酶可能暫時增高，膽汁瘀滯性黃疸，特別是以往有肝損害的病人更易出現這些不良反應。血清中尿素氮、肌酐或膽紅素暫時升高，個別病人出現高血糖，結晶尿或血尿現象。局部反應：靜脈炎或血栓性靜脈炎。
3、司氟沙星的其它不良反應：即使嚴格按醫生要求服藥，司氟沙星可影響病人駕駛或操作機器的反應能力，尤其是同時飲酒的病人。