1、吡喹酮片治療寄生于組織內的寄生蟲如血吸蟲、肺吸蟲、囊蟲等，由于蟲體被殺死后釋放出大量的抗原物質，可引起發熱、嗜酸粒細胞增多、皮疹等，偶可引起過敏性休克，必須注意觀察。
2、腦囊蟲病患者需住院治療，并輔以防治腦水腫和降低高顱壓（應用地塞米松和脫水劑）或防治癲癇持續狀態的治療措施，以防發生意外。
3、合并眼囊蟲病時，須先手術摘除蟲體，而后進行藥物治療。
4、嚴重心、肝、腎患者及有精神病史者慎用吡喹酮片。
5、有明顯頭昏、嗜睡等神經系統反應者，治療期間與停藥后24小時內勿進行駕駛、機械操作等工作。
6、吡喹酮片在囊蟲病驅除帶絳蟲時，需應將隱性腦囊蟲病除外，以免發生意外。