1.可見皮疹、蕁麻疹、紅斑、藥物熱等過敏反應；罕見過敏性休克。
2.消化系統：可見惡心、嘔吐、食欲減退、腹痛、腹瀉、便秘等胃腸道癥狀。
3.肝毒性：少數患者用藥后可出現肝異常（天門冬氨酸氨基轉移酶、丙氨酸氨基轉移酶一過性升高）。
4.腎毒性：少數患者用藥后可出現尿素氮、肌酸、肌酐一過性升高；偶有致間質性腎炎的報道。
5.血液系統：少數患者用藥后可出現血紅蛋白降低，血小板、中性粒細胞減少，嗜酸粒細胞增多癥。
6.長期大劑量使用噻吩甲氧頭孢霉素可致菌群失調，發生二重感染。還可能引起維生素K，維生素B缺乏。
7.肌內注射部位可出現硬結、疼痛:靜脈注射劑量過大或過快時可產生灼熱感、血管疼痛，嚴重者可致血栓性靜脈炎。