1、急性腎功能衰竭：
帕珠沙星可能會引起急性腎功能衰竭。
肝功能異常、黃疸。
2、偽膜性腸炎：
可發生伴有血便的嚴重的腸炎，如果出現腹痛或頻繁的腹瀉，應立即停帕珠沙星并采取相應的防治措施處理。
粒細胞減少、血小板減少癥。
3、橫紋肌溶解：
如果出現肌痛、虛弱、磷酸肌酸激酶（CPK）升高、血或尿中的肌球素升高，應立即停藥。橫紋肌溶解也可導致急性腎功能衰竭、痙攣、休克、過敏反應，若出現呼吸困難、水腫、紅斑等任何異常，應停止帕珠沙星，并采取適當處理措施。
表皮脫落壞死（Lyell綜合癥），眼、粘膜、皮膚綜合癥（Stevens Johnson綜合癥）。
4、間質性肺炎：
伴有發熱、咳嗽、呼吸困難、胸部X片異常的肺炎發生。
5、低血糖：
嚴重低血糖，易發生于老年病人、腎功能衰竭病人，應仔細觀察。
跟腱炎、肌腱斷裂。給藥期間應密切觀察，如出現上述不良反應，應立即停帕珠沙星，并采取相應的處理措施。