可引起胃腸道反應：惡心,嘔吐,食欲不振,腹脹,腹瀉.皮疹,白細胞減少.轉氨酶升高.可引起二重感染,偽膜性結腸炎.也可有呼吸困難,嘴唇腫脹,鼻腔腫脹,流淚和過敏反應.有報告，本品引起偽膜性腸炎的發生率是最高的，可能超過2%。
約10%用克林霉素治療的人出現皮疹，其它如滲出性多形性紅斑、可逆性血清谷草氨基轉移酶及血清谷丙氨基轉移酶升高、粒細胞減少、血小板減少及其它過敏反應等偶可見。
