消化道疾病如潰瘍、藥物（如阿司匹林、糖皮質激素、吲哚美辛等）對胃黏膜的損傷、腸結核、克羅恩病、潰瘍性結腸炎、鉤蟲病、結腸息肉以及消化道腫瘤（如胃癌、結腸癌等），糞便隱血試驗常為陽性。
消化道潰瘍經治療后糞便顏色已趨正常，但隱血試驗陽性仍可持續5～7天，隱血試驗轉為陰性可作為判斷出血完全停止的可靠指標。隱血試驗可作為消化道惡性腫瘤普查的一個篩選指標，其連續檢測對早期發現結腸癌、胃癌等惡性腫瘤有重要的價值。
