mRNA分子的合成始于轉錄，并最終以降解結束。在被翻譯之前，真核mRNA分子通常需要大量加工和轉運，而原核mRNA分子則不需要。真核mRNA分子和它周圍的蛋白質一起被稱為信使RNP。
轉錄
轉錄是指由DNA合成RNA的過程。在轉錄期間，RNA聚合酶根據需要將一個基因的DNA拷貝成mRNA，這個過程在真核生物和原核生物中是相似的。
與原核生物明顯不同的是，真核RNA聚合酶在轉錄過程中與mRNA加工酶結合，因此，真核生物的mRNA加工可以在轉錄開始后快速進行。短壽命的未加工或部分加工的轉錄產品稱為前體mRNA或pre-mRNA；一旦加工完全，它被稱為成熟mRNA。
真核pre-mRNA加工
mRNA的加工在真核生物、細菌和古細菌中差異很大。實質上，非真核mRNA在轉錄時是成熟的，除極少數情況外不需要加工。然而，真核pre-mRNA需要大量加工。
5’端加帽子：5‘ 帽（也稱為RNA帽，RNA 7-甲基鳥苷帽或RNA m7G帽）就是一個經修飾的鳥嘌呤核苷酸，在轉錄開始不久后就被添加到新產生的真核mRNA的“前”即5'末端。 5’帽由末端7-甲基鳥苷殘基組成，它通過5'-5'-三磷酸鍵與第一轉錄出的核苷酸連接。它的存在對于核糖體的識別和對mRNA的保護至關重要。
3’端加尾：是指聚腺苷酰基部分與mRNA分子的共價連接。在真核生物中，大多數信使RNA（mRNA）分子在3'末端被多聚腺苷酸化。Poly A尾巴和與其結合的蛋白質有助于保護mRNA免于被核酸外切酶降解。3’端加尾對于轉錄終止，從細胞核輸出mRNA和翻譯也很重要。 原核生物中的mRNA也常被3’端加尾，但此時的poly（A）尾巴促進而不是防止核酸外切酶對mRNA的降解。
mRNA的轉運
真核生物和原核生物之間的另一個區別是mRNA的轉運。由于真核轉錄和翻譯是在不同的細胞器內進行的，真核mRNA必須從細胞核輸出到細胞質。 這一過程可能受不同信號通路的調節。成熟的mRNA通過其加工的修飾被識別，在結合帽結合蛋白CBP20和CBP80及轉錄/輸出復合物（TREX）后通過核孔被輸出到細胞質。
mRNA的翻譯
因為原核mRNA不需要加工或轉運，所以原核生物mRNA在核糖體的翻譯可以在轉錄結束后立即開始。因此，可以說原核生物的mRNA翻譯與轉錄偶聯發生。
mRNA的翻譯 [5]
已經加工并轉運至細胞質的真核mRNA（即成熟mRNA）在核糖體的翻譯發生在細胞質中自由漂浮的核糖體中，或者通過信號識別顆粒導向到的內質網中。因此，與原核生物不同，真核生物的mRNA翻譯不直接與轉錄偶聯。在某些情況下甚至可能發生這樣的情況，即mRNA水平的降低卻伴隨著蛋白質水平的增加。