任何物質都處于不斷運動中，液體環境中的熒光分子也不例外。因此當受到偏振光激發時，熒光分子的運動狀態(如旋轉或翻轉)、熒光分子與其他因子相互作用(如相互結合或排斥)、其所處環境的性質(如溶液的黏度、溫度_等因素都可能對熒光分子受激發后發出的偏振光的性質產生影響。對此進行分析比較，就可能揭開物質活動的內在規律，達到研究目的。熒光體的熒光偏振與熒光各向異性值的測定，能夠提供與熒光體在激發態壽命期間動力學相關的信息，因此熒光偏振技術被廣泛應用于研究分子間的作用，例如蛋白質與核酸、抗原與抗體、蛋白質與多肽的結合作用等。
熒光偏振技術比研究蛋白質與核酸結合的傳統方法具有更多優勢(特別是不生成有害的放射性廢物)，并且檢測限更低，可達到亞納摩爾級范圍。此外，熒光偏振是真正均相的，允許實時監測(動力學監測)，對濃度變化不敏感，是均相檢測形式的最佳解決方案。