傅立葉變換紅外光譜加一個顯微鏡就可進行顯微紅外光譜分析，其特點為：
①靈敏度高，檢測限可低至10納克，幾納克的樣品就能獲得很好的紅外光譜圖；
②能進行微區分析，其顯微鏡測量孔徑可到8微米或更小，在顯微鏡觀察下，可方便地根據需要選擇樣品不同部分進行分析。對非勻相樣品可在顯微鏡下直接測量樣品各個相的紅外光譜圖。對于固體不均勻混合物，可直接測定各個固體微米區域組分的紅外光譜圖；
③樣品制備簡單，對不透光樣品可直接測定反射光譜；
④顯微鏡光路調節簡單，顯微觀察與紅外光譜分析是同一光路，容易實現顯微鏡對樣品待分析部位定位；
⑤分析過程中可保持樣品原有形態和晶型，樣品不被破壞。
⑥測試環境非真空，可測試易揮發物質；典型的非破壞性；
⑦能識別有機官能團，通常是具體的有機化合物；具有識別化合物的豐富光譜庫