① 固體壓片或液膜法制樣麻煩, 光程很難控制一致, 給測量結果帶來誤差。另外, 無論是添加紅外惰性物質或是壓制自支撐片, 都會給粉末狀態的樣品造成形態變化或表面污染,使其在一定程度上失去其“本來面目”
②大多數物質都有獨特的紅外吸收, 多組分共存時, 普遍存在譜峰重疊現象。
③透射樣品池無法解決催化氣相反應中反應物的“短路”問題, 使得催化劑表面的吸附物種濃度較低, 影響檢測的靈敏度。
④ 不能用于原位(在線) 研究, 只能在少數研究中應用。因此, 漫反射傅里葉變換紅外光譜技術和衰減全反射傅里葉變換紅外光譜技術應運而生。