1．耳鼻咽喉科檢查：可發現某些先天發育異常和急、慢性感染灶。
2．病原微生物檢測：應進行多病原聯合檢測，以了解致病微牛物。
3．肺部CT和氣道、血管重建顯影：可提示支氣管擴張、氣道狹窄(腔內阻塞和管外壓迫)、氣道發育畸形、肺發育異常、血管壓迫等。
4．免疫功能測定：有助于發現原發、繼發免疫缺陷病。包括體液免疫、細胞免疫；補體、吞噬功能等檢查，也應注意有無頑固濕疹、血小板減少、共濟失調、毛細血管擴張等異常。
5．支氣管鏡(包括硬質、纖維和電子支氣管鏡)檢查：可診斷異物、支氣管擴張、氣道腔內阻塞和管外壓迫、氣道發育畸形等。
6．肺功能測定：通氣功能測定和必要時進行的支氣管激發試驗、支氣管舒張試驗，有助于鑒別變態反應性下呼吸道疾病；換氣功能和彌散功能測定可利于鑒別某些間質性肺疾患。
7．特殊檢查：懷疑患有原發性纖毛運動障礙時，可行呼吸道(鼻、支氣管)黏膜活檢觀察纖毛結構、功能；疑有囊性纖維性變時，可進行汗液氯化鈉測定和CFRT墓因檢查；疑有反復吸人時，可進行環咽肌功能檢查或24小時pH測定。