依據病史、癥狀、體征及檢查一般可以診斷，但是兒童鼻竇炎由于癥狀不明顯，患兒不會訴說，并且檢查時不配合，因此在診斷方面較成人困難。
1、在孩子患感冒1周以上，經治療鼻塞、流涕等癥狀未見減輕反而加重，鼻塞及黃膿涕增加，應考慮有鼻竇炎的可能。
2、全身癥狀較成人明顯：如急性鼻竇炎可有發高燒及中毒癥狀，甚至出現脫水、抽搐，有時可有惡心、嘔吐、咳嗽等，慢性鼻竇炎可有低熱、精神不振、食欲欠佳、體重下降、記憶力差等癥狀。
3、鼻腔及局部檢查：急性鼻竇炎時，鼻竇鄰近軟組織的紅、腫、壓痛及鼻涕倒流入咽部的現象較成人多見，鼻腔檢查非常重要，可用小兒鼻鏡作前鼻孔檢查，急性鼻竇炎鼻腔粘膜呈急性充血、腫脹；鼻腔內蓄有大量膿涕，鼻涕倒流入咽部等現象較成人為多見，可以觀察到咽后壁處有膿涕從鼻咽部流下。慢性鼻竇炎則可見鼻前庭結痂，小兒下鼻甲肥大，收縮下鼻甲后檢查，則可見到中鼻道及嗅溝處有膿液積聚，檢查時應注意鼻底、鼻后部、中鼻道及嗅溝粘膜有無膿液及紅腫，或鼻頂部有無息肉。
4、鼻竇CT掃描：X線攝片對鼻竇炎診斷意義不大。當考慮有占位性病變或常規治療無效時CT掃描對于診斷兒童鼻竇炎有較好的價值。
必須強調，兒童鼻竇炎常常不是一個孤立的疾病，急性者常以上呼吸道感染的并發癥出現，但癥狀和體征比“上感”更為嚴重，慢性者常伴有臨近器官的病變，如中耳炎、腺樣體肥大、哮喘及支氣管炎等。