（1）單發型空、回腸閉鎖手術 空腸遠端和回腸單發閉鎖施行腸切除端端或端斜吻合術。①近端腸管裁剪尾狀成形端端吻合術。②近端擴張腸管折疊縫合術：優點是增加小腸黏膜吸收面，對可能發生短腸綜合征的病例尤為有利。③擴張腸管裁剪吻合加支架管優點是術后充分減壓，保證吻合口通暢和愈合。缺點是增加手術時間，硅膠管可能壓迫小腸。
（2）蘋果皮樣（Apple-Pee1）閉鎖手術 患兒伴有低體重、多發性畸形或全身情況欠佳者，宜采用簡捷術式，可行Santulli造瘺術。將擴張的近端腸管與遠端腸管行T字形側端吻合，近段腸管造瘺。也可行Bishop-Koop造瘺術，近端腸管與遠端空腸倒T字形端側吻合，遠端腸管造瘺，術后給胃腸道外營養，2～3個月后全身情況改善后行關瘺手術。
（3）多發性閉鎖手術 首先判斷閉鎖部位的數目和類型，本型表現為Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型及狹窄并存。手術原則是妥善處理近端擴張腸管，最大限度保留小腸，尤其是保留末端回腸和回盲瓣。術后中心靜脈插管長期全胃腸外營養（TPN）。2個月后經造影證實各個吻合口通暢，行二期腸吻合術。
（4）瓣膜切除術 對瓣膜閉鎖及狹窄的病例，可行瓣膜切除術。