免疫傳感器可以用來進行DNA分子的識別、測序。其原理是將有反應性的一單股核苷酸(長度在18～50 個堿基之間)固定在某種支持物(傳感器)上作為探針，可以在復雜環境成份下特異地識別出某一靶子底物 ，并通過換能裝置轉換成可以檢測到的光電信號。
檢測的方法有熒光型和表面等離子體共振(SPR)型傳感器。熒光檢測法是在 DNA 探針中或待測靶基因中標上熒光標記物 ，也可在 DNA 雜交后加入熒光標記物。通過測定熒光標記嵌入 DNA 雙螺旋間所導致的熒光信號的變化，檢測 DNA. Krull 等以共價固定在石英表面的DNA探針與溶液中其靶基因雜交45min后，與熒光嵌入染料溴乙啶( EB)反應 ，根據熒光強度與溶中互補 DNA 的量的正比關系進行分析，可檢測出86 μg/L 的 DNA. Bier 等以花青二聚體 YOYO 及Picogreen作為與 DNA 雙鏈緊密親和的熒光嵌入劑，由于與DNA雜交體間的雙嵌入作用，使得完全配對、單堿基錯配及兩個以上不匹配所產生的熒光信號有明顯不同，從而能夠明顯區分不同DNA序列。還可以用表面等離子體共振傳感器檢測 DNA 序列 ,Bier 等做了這樣的工作。