免疫印跡法是在蛋白質電泳分離和抗原抗體檢測的基礎上發展起來的一項檢測蛋白質的技術，它將SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的高分辨力與抗原抗體反應的高特異性相結合。
第一階段為SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS-PAGE）。抗原等蛋白樣品經SDS處理后帶負電荷，在聚丙烯酰胺凝膠中從陰極向陽極泳動，分子量越小，泳動速度就越快。此階段分離效果肉眼不可見（只有在染色后才顯出電泳區帶）。
第二階段為電轉移。此階段分離的蛋白質條帶肉眼仍不可見。
第三階段為酶免疫定位。將印有蛋白質條帶的硝酸纖維素膜（相當于包被了抗原的固相載體）依次與特異性抗體和酶標第二抗體作用后，加入能形成不溶性顯色物的酶反應底物，使區帶染色。常用的HRP底物為3，3-二氨基聯苯胺（呈棕色）和4-氯-1-萘酚（呈藍紫色）。陽性反應的條帶清晰可辨。并可根據SDS-PAGE時加入的分子量標準，確定各組分的分子量。