常用的標記物有熒光素、酶、放射性核素及膠體金等。免疫標記技術具有快速、定性或定量甚至定位的特點，是應用最廣泛的免疫學檢測技術。
常用的免疫熒光素主要有：
1 ．異硫氰酸熒光素 (FITC) ，最大吸收光譜為 490~495nm ，最大發射光譜為 520~530nm ，呈黃綠色熒光。
2 ．四乙基羅丹明 (RB200) ，最大吸收光譜為 570nm ，最大發射光譜為 595~600nm ，呈明亮橙色熒光。
3 ．四甲基異硫氰酸羅丹明 (TRITC) ，最大吸收光譜為 550nm ，最大發射光譜為 620nm ，呈橙紅色熒光。