免疫熒光組織化學是現代生物學和醫學中廣泛應用的技術之一，是由Coons和他的同事(1941)建立，免疫熒光技術與形態學技術相結合發展成免疫熒光細胞（或組織）化學。它與葡萄球菌A蛋白（SPA）、生物素與卵白素、植物血凝素（ConA等）相結合拓寬了領域；
與激光技術、電子計算機，掃描電視和雙光子顯微鏡等技術結合發展為定量免疫熒光組織化學技術；熒光激活細胞分類器Fluorescin activated cell sorter（FACS）的應用，激光共聚焦顯微鏡的問世，使免疫熒光細胞技術發展到更高的階段，開創了免疫熒光技術的新領域。
細胞顯微分光光度計與圖像分析儀的結合使免疫熒光組織化學的定量檢測更加準確。80年代到90年代相繼又有新的熒光素出現如R-藻紅朊、B-藻紅朊、C-藻青蛋白、cy2、cy3、cy5和cy7等均在流式細胞儀和激光共聚焦顯微鏡中廣泛應用。