如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話，那么要數對RNA修飾的研究了，此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能，顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力？還是研究從細胞和組織中收集的RNA是怎么對宿主細胞功能的產生影響和致病的？然后，現實告訴我們，這項研究工作幾乎是無止境的。
通常，設置實驗中最具挑戰性的部分之一是每一步實驗操作的處理方式。 為了向您提供表觀遺傳研究的完整解決方案，EpiGentek以試劑盒和信息的形式提供了全套病毒RNA修飾研究的工作流程解決方案，如下圖。
首先我們了解一下研究背景：
m6A RNA甲基化和去甲基化循環
m6A RNA的形成是由多蛋白質甲基轉移酶復合物調控的，部分由METTL酶調控。最近的研究發現，在哺乳動物中存在這些甲基化酶“寫入者”及其相關的去甲基酶“擦除者”，揭示出 RNA m6A甲基化修飾是可逆的，如下圖所示。 一個甲基通過METTL3 / 14異二聚體以化學方法加入到腺苷（A）殘基的氮6位上，形成了N6-甲基腺苷（m6A）。 然后，m6A可以通過FTO介導的氧化脫甲基作用，逐步轉化為N6-羥甲基腺苷（hm6A），隨后轉化為N6-甲酰腺苷（f6A），最后最終還原為原始腺苷酸（A）。
m6A修飾對RNA病毒生命周期的影響
已知表觀遺傳修飾會影響人類冠狀病毒等RNA病毒的生命周期。據報道，像N6-甲基腺苷（m6A）這樣的腺苷甲基化修飾可通過調節病毒帽結構，病毒基因表達，病毒傳代，先天傳感途徑和先天免疫應答來影響某些RNA病毒的生存能力。 m6A的獲得或喪失可導致RNA病毒發生重大功能變化，從而改變其宿主細胞的融合/進入，復制，傳播，致病強度和免疫逃逸。宿主細胞的m6A轉錄組在宿主抵抗性能中起作用，在病毒感染后也可能因此而發生改變。
新冠病毒SARS-CoV-2基因組的長度超過29,800個核苷酸，包含50多個潛在的m6A位點，這些甲基化位點的堿基是RNA甲基化酶復合體METTL3 / 14修飾的m6A特定堿基，包括GGACU（T），GGACA ，以及GGACC。因此，新冠病毒SARS-CoV-2 RNA中所有腺苷中有大于 0.64％，或大于0.18％的所有堿基都可能是m6A修飾的。因此，總RNA中的m6A定量和整個轉錄組的m6A定位對于研究與m6A相關的病毒功能和相應的機制以及確定抗病毒治療的新靶標至關重要。